يهدف برنامج علوم البيئة إلى:

1. تطوير وتأهيل كوادر علمية من خلال تقديم تعليم عالي متميز للطلبة الملتحقين بالبرنامج حيث يكسبهم المعارف العلمية اللازمة ومهارات التفكير العلمي المنظم . ولقد تم وضع فلسفة وأهداف البرنامج انطلاقا من فلسفة وأهداف الجامعة الرئيسية ومن خلال فلسفة وأهداف كلية العلوم، و يمكن صياغة أهداف البرنامج كما يلي :

2. تغطية حاجة المجتمع بالمختصين في مجال علوم البيئة.

3. المساهمة في حل المشاكل البيئة التي يعاني منها المجتمع.

4. إجراء الأبحاث و الدراسات البيئية التي تعنى بالمشاكل البيئية المختلفة.

5. التعرف على المصادر الطبيعية من خلال الأبحاث البيئية وطرق استغلالها.

6. ترشيد استخدام المصادر الطبيعية مع الأخذ في الاعتبار الأبعاد و المخاطر البيئية.

7. عقد دورات تدريبية في مجالات التحاليل البيئية و التقييم البيئي.

8. زيادة الوعي البيئي بين أبناء شعبنا عن طريق عقد ندوات و محاضرات عامة.

9. المشاركة في مشاريع إقليمية ودولية من شأنها أن تساهم بالمحافظة على البيئة على المستوى الإقليمي والعالمي.