تتمثل الاهداف الرئيسية للمعمل في :

1. تطويرنظام ادارة المعامل ورفع قدرات الكوادر الفنية والوصول الي اليات مستدامة للتمويل الذاتي.
2. نشر ثقافة جودة المعامل في المجالات التطبيقية ورفع مستوي ادائها طبقا للمعايير الدولية
3. تقوية وتفعيل العلاقة بين المؤسسات التعليمية والمجتمع الإنتاجي والخدمي.
4. يقوم المعمل باجراء اختبارات كفاءة طبقا للمواصفة القياسية.
5. يقوم المعمل باجراءات تحاليل المياه طبقا للمعايير القياسية.